رأت وزارة الخارجية الإيرانية ان "إغتيال رئيس إتحاد علماء بلاد الشام العلامة الشيخ محمد سعيد رمضان البوطي سيحبط المخططات الأميركية - الإسرائيلية لإثارة الفتنة الطائفية بالمنطقة".
ودانت الوزارة في بيان، بشدة "إغتيال البوطي"، واصفةً إياه بأنه "جريمة لا إنسانية ومعادية للدين منفذوها قساة القلوب ومن أعداء الشعب السوري"، واصفةً البوطي بأنه "كان من كبار الشخصيات المنادية بالتقريب بين المذاهب الإسلامية والمقاومة الإسلامية ضد إسرائيل".
كما دعت علماء العالم الإسلامي والمراكز الدينية إلى "إدانة هذه الجريمة الكبرى وسائر الممارسات اللاإنسانية بما فيها قيام الإرهابيين بإستخدام السلاح الكيميائي"، مطالبةً الجميع بـ"بذل الاهتمام المسؤول من أجل وقف العنف وبدء الحوار الوطني لإنهاء الاشتباكات في سوريا".
